Chương trình ưu tiên tài trợ các nghiên cứu cơ bản gắn với hướng phát triển công nghệ chiến lược và sản phẩm công nghệ chiến lược, các nhóm nghiên cứu mạnh và hướng nghiên cứu tiềm năng tạo đột phá gắn với lợi thế phát triển Việt Nam.

Bộ Khoa học và Công nghệ xác định đây là nền tảng để tạo ra các đột phá về tri thức và công nghệ, hình thành năng lực làm chủ công nghệ lõi, công nghệ chiến lược và nâng cao năng lực cạnh tranh quốc gia. Do đó, Việt Nam sẽ chuyển từ mô hình tài trợ các nhiệm vụ nghiên cứu đơn lẻ, ngắn hạn sang đầu tư định hướng nghiên cứu trung và dài hạn, đảm bảo tích lũy tri thức và hình thành năng lực nghiên cứu dẫn dắt.

Bộ khuyến khích ý tưởng mới, đột phá, chấp nhận rủi ro khoa học phù hợp với đặc thù của nghiên cứu cơ bản, đồng thời áp dụng cơ chế quản lý theo kết quả đầu ra và tác động khoa học

Mục tiêu cụ thể của chương trình là hình thành các nhóm nghiên cứu mạnh về khoa học tự nhiên, có năng lực dẫn dắt và tạo ra ảnh hưởng tầm quốc tế. Chương trình hướng tới nâng cao chất lượng và mức độ ảnh hưởng của nghiên cứu cơ bản, từng bước nâng cao vị thế khoa học Việt Nam trong một số lĩnh vực trọng điểm.